小行星|达安科普:等温扩增和荧光定量PCR在新冠核酸快速检测中的应用


小行星|达安科普:等温扩增和荧光定量PCR在新冠核酸快速检测中的应用
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小行星|达安科普:等温扩增和荧光定量PCR在新冠核酸快速检测中的应用
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这两年 , 全球在疫情笼罩下 , 分子生物学技术迅速发展 , 建立的新冠核酸快速检测的诊断方法——荧光定量PCR 和恒温扩增日渐受关注 。
【小行星|达安科普:等温扩增和荧光定量PCR在新冠核酸快速检测中的应用】环介导等温扩增技术( loop -mediated iso-thermal amplifeationLAMP)是日本学者Notomi提出的一种核酸等温扩增技术其原理是基于DNA在65℃左右处于动态平衡状态 , 利用4种不同的特异性引物识别靶基因的6个特定区域 , 通过Bst DNA聚合酶的链置换功能以及Inter Primer和OuterPrimer的相互作用最终达到对目的片段进行大量扩增 。
而PCR是利用DNA在体外摄氏95高温时变性会变成单链 , 低温(经常是60℃左右)时引物与单链按碱基互补配对的原则结合 , 再调温度至DNA聚合酶最适反应温度(72℃左右)DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链;其变性、复性、延伸实际就是一个温控过程 。
两者的主要区别:
但是结合新型冠状病毒的狡猾多变 , 每一次不一样的“新”变异病株 , 在面对我国人口大国 , 其密集人流量大、个体疾病基因类型多的实际国情 , 在出现确诊患者的管控区域内 , 需实现第一时间全区域新冠核酸快速检测筛查 , 并溯源调查密切接触者 , 严控疫情发生跨区域性传播 。
所以 , 对于实际的新冠核酸快速检测而言 , qPCR由于引物设计的成熟和荧光通道的多样性 , 其分子诊断仪器也发挥着高通量的重要性;加上目前国内样本量大会存在多数实验室不能严格分区 , LAMP方法一旦开盖容易形成气溶胶污染 , 容易产生假阳性问题 。
虽然LAMP很好地解决了PCR的温控难题 , 同时也相应带来了其他的问题 , 相对于PCR很成熟的技术体系而言 , 未来我们也期待以等温扩增技术的不断优化和发展 , 两者技术互补 , 为新冠核酸诊断研发出更好的新冠核酸快速检测试剂盒 。